MegaBOLT

是一套高性能的重测序分析系统, 包含全基因组测序(WGS) 和全外显子测序(WES),完成从测序序列文件 fq.gz 输入至变异检测结果 vcf.gz 输出的计算,通过 FPGA(即现场可编程门阵列)硬件加速卡进行计算加速。

快速
采用CPU与FPGA异构方式,极大地提高了分析速度,在全基因组(WGS)及全外显子组(WES)的分析速度上,与传统GATK流程有16~20倍的飞跃
易用
提供图形化分析界面,支持个性化流程的定制。用户一键启动分析任务,无须生物信息技术背景,摆脱枯燥复杂的命令行界面,轻松简洁,随点随用
经济
大幅提升计算效率,严格控制计算硬件成本,这使得性价比直线上升。相比较于传统的CPU计算方式,WGS和WES分析价格降幅达70%以上

BGI Online平台MegaBOLT流程

GATK vs MegaBolt

&

加速效果比对
对GATK 3.7 Haplotype Caller变异检测算法进行了硬件加速,配合全流程其他模块的加速,在相同服务器配置下,MegaBOLT流程整体达到16~20倍提速。

CPU与FPGA异构方式实现高速序列分析

MegaBOLT采用CPU+FPGA异构的计算架构,完成从测序数据FASTQ输入,至变异检测结果VCF/gVCF,及比对结果BAM的输出。

与常规的分析流程相比 MegaBOLT 拥有:
  • 专为生信计算编辑的FPGA硬件逻辑电路
  • 多流水线式计算结构
  • 高度并行化计算结构