测序服务商

BGI Online全面支持国产测序仪BGI-SEQ500数据

BGISEQ-500是华大自主开发的桌面型、高通量、一站式、开放性测序平台。配合可选的全自动文库制备系统和全自动样品加载系统,从测序到数据分析结果,最快完成周期可缩短在24小时内。为了能够让测序后的数据更加方便的进行分析与解读,目前BGI Online平台上已经有免费的公共流程,全面支持BGISEQ-500的测序数据,其中包括全基因组分析、全外显子分析、RNA-Seq数据分析。

科研工作者

BGI Online助力遗传病组学研究

BGI Online平台为罕见病项目提供了基因组大数据解决方案,除了云计算和海量存储,交互式的流程搭建和可视化的任务管理也使数据分析工作更便捷。最终助力遗传病组学研究在24小时内完成储存峰值超过10T、超过1000个计算任务的87个家系的分析,发现上百万个突变,从中鉴定出186个Denovo突变,进一步研究锁定8个高置信候选致病基因。

任务

家系

突变

企业和机构

24小时内完成千人基因组分析

华大基因、阿里云和安徽医科大学在平台BGI Online用时21小时47分12秒完成了1000例人类全外显子组数据的分析,创造了基因数据分析的“深圳速度”。该项目的全外显子组数据来源于1000例银屑病样本,采用NimbleGen 34M捕获芯片,数据的平均测序深度为30X。数据分析采用GATK best practice流程。全流程包括11个模块,1000个样品总计11000+个jobs。采用JOB GUARDING技术控制任务,任务运行成功率达100%。只需点击四次,在BGI Online平台上即可开始执行任务,1000个WES分析在24小时内全部成功地完成。

生信开发者

单细胞基因组的云端分析

2016年,华南理工大学蔡宏民教授的团队开始研究单细胞测序的流程和数据分析。为了推动研究进展,蔡教授团队引用了Navin在Nature发表的单细胞测序流程,把特定工具封装在BGI Online上,并使用这些工具搭建了一个单细胞基因组分析流程。从任务开始到获得结果分析图表,用时只需12.7个小时,而线下运行完该流程则需要3-5天左右的时间。目前该流程发布在BGI Online,用户只需要把源数据上传到该平台,即可方便地对单细胞测序数据进行研究,同时可视化的任务管理使信息分析工作更直观高效。